Товары

Добавляем компонент в карточку товара, выводим его по значению $arResult["CATALOG_QUANTITY"] == 0, когда товар отсутствует, в компоненте каталога также должна быть прописана переменная action.

Если нужно удалить товары которых нет в наличии в большом количестве не нагружая сервер, и при этом не использовать крон, можно скрипт поставить  на ajax запросы.